南通港位于长江下游北岸，江苏省东部的南通市境内，东濒黄海、南临长江，是长江下游唯一处于苏中、苏北地区的大型港口，为国家一类对外开放口岸，国家主枢纽港，也是上海国际航运中心组合港的主要成员。港口沿长江上溯至南京253.7千米；下行至吴淞口96.3千米，长江入海口195.5千米，地理位置非常优越，是理想的大宗货物中转集散中心。
南通港长江段岸线区域自如皋又来沙四号港闸至海门港闸。港口处于江、河、海联运的枢纽地位，东出长江入海可以与我国南北沿海各港口和世界各港通航；上溯长江，可联系苏、皖、赣、鄂、湘、川6省内河通过港口引河与通扬、通吕运河等苏北水系和京杭大运河贯通。陆路与国道204、宁通、通盐、通启和G15、G40高速公路连接。南通兴东民航机场距港区仅20千米，目前已开辟了至北京、广州、深圳、大连、厦门、南京等地的定期航班，海、陆、空立体交通运输的新体系已经形成。
该港现辖如皋、天生、南通、任港、狼山、富民、江海、通海等8个沿江港区和吕四、洋口2个沿海港区，有生产用码头泊位109个，码头岸线总长17540米，其中万吨级以上码头泊位54个。
如皋港区位于如皋港经济开发区岸线内，上界自如皋又来沙四号港闻，下界至洪北沙西南角，拥有可利用岸线3000米～4000米，陆域纵深1200米～1500米。主要为如皋经济开发区招商引资和工业开发服务，是承担油品、液体化工及散杂货储运为主的港区。
天生港区上界自小李港，下界至通吕运河口，岸线长约7500米，陆域纵深1200米。主要承担煤炭、杂货运输任务，为电厂、港闸开发区和临港工业服务。主要有天生港电厂、华能电厂、热电厂、建材厂、越江港务等千吨级长江码头和通吕散货码头、通沙码头
南通港区上界自通吕运河口，下界至南通粮油进出口接运公司与中远南通船厂的分界线，岸线长约1400米，陆域纵深500米～800米，是主要承担散杂货运输并兼顾客运的公用港区。
任港港区上界自南通粮油进出口接运公司下游侧，下界至姚港河口，岸线长约2400米，陆域纵深500米～800米，是主要为船舶工业服务的临港工业港区。
狼山港区上界自姚港河口，下界至狼山龙爪岩取水口上游1千米处，岸线长约3250米，陆域纵深700米～1200米，是以承担大宗散货、集装箱以及散杂货运输为主的综合性港区，包括姚港、狼山、集装箱3个港务公司。
富民港区上界自库子港河口，下界至老洪港风景区上游段，岸线长约4500米，陆域纵深800米，是承担杂货、液体化工为主的港区，主要为国家级南通经济技术开发区服务。
江海港区上界自老洪港风景区下游段，下界至东方红涵洞，岸线长约5200米，陆域纵深1200米，是以承担原材料、成品油及液体化工运输为主的公用港区。
通海港区上界自东方红函洞，下界至海门港间，规划岸线长约10千米，其中约5千米沿岸的水深可达20米，陆城纵深1500米，是以集装箱、大宗散货为主的综合性港区。
吕四港区为利用大洋港外小洪深水槽内建设的深水泊位港区，大电厂在该港区内建有煤炭专用泊位。
洋口港区为利用烂沙洋深槽建设的深水泊位港区，以公用码头和临港工业的头为主。
南通港港口设施齐全，助航标志完善，港域宽阔、水深，万吨级船舶四季均能通航。船舶装卸货物以靠泊码头作业为主，同时也可进行过驳作业。目前，南通港拥有长江沿线最为先进的散货作业系统，吨位最大的散货码头，面积最大的长江港池，已成为长江沿线最大的矿石中转基地，最大的大豆、菜籽进出口基地。
南通港是我国长江下游对外贸易口岸和进出口物资江海中转主枢纽港之一，上海国际航运中心组合港之一，担负着南通市和苏北地区内、外贸易运输，长江中、上游大宗散货的中转和外贸进出口运输及旅客运输。作为我国首批对外开放港口，目前已与日本、美国、欧洲、香港等100多个国家和地区的300多个港口通航。南通港地处长江入海口，背靠苏北平原，有着十分广阔的经济腹地，是江苏省中部重要的经济发展地区，中转腹地为长江沿线的6省1市，同时还涉及云、贵、豫、陕等省，进出港的主要货种为煤炭、金属矿石、钢铁、矿建材料、水泥、化肥、木材、棉花、糖、杂货等。2014年，港口完成货物吞吐量2.16亿吨，其中外贸货物吞吐量4813.6万吨，集装箱吞吐量71.1万标准箱。
潮汐 该港属不正规半日潮港。平均高潮高3.82米，平均低潮高1.86米，平均潮差2米。最高潮高6.38米，最低潮高0.42米，历史最高潮位7.08米（1997年8月19日）。历史最低潮位0.42米（1956年2月29日）。历史最大潮差4.01米（1959年9月6日）。潮位特征值以吴淞零点为基准面。
潮流该港水域为往复流，涨、落潮流向基本与岸线平行，涨潮流逆江而上，落潮流顺江而下，水流平稳，涨潮最大流速2.6节，平均流速2.1节，基本流向320°；落潮最大流速1.9节，平均流速1.7节、基本流向150°。
风 受季风气候影响，冬半年盛行西北风、夏半年以东南风为主。全年以东风出现频率最高，春季常风向为东东南，夏季常风向为东东南、东南，秋季常风向为东北，冬季常风向为北西北。年平均风速3.0米/秒，各月中以4月平均风速最大为3.4米/秒，10月最小，为2.6米/秒。各季中以春季平均风速最大，秋季最小，春夏秋冬各季平均风速分别为3.3米/秒、3.0米/秒、2.7米/秒、3.1米/秒。
南通港历年极端最大风速（10分钟平均）为26.3米/秒，风向东北。累年年平均（1951年一1999年）大风（≥8级）日9.3天。累年平均出现大风次数最多的是8月，平均每年1.2次，最少的是10月，为0.3次。瞬时极大风速为30.4米/秒。春季最大风速为25.0米/秒，夏季最大风速为26米/秒，秋季最大风速为18.3米/秒，冬季最大风速为20.0米/秒。
南通港从5月下旬至11月上甸都有可能遭受台风袭击，在7月上旬到9月中旬期间相对集中。台风影响时，大风风向主要出现在偏东南方向，而偏西方向的大风出现机率较小。1949年－1997年，中心通过南通境内的台风有22个，主要集中在7、8、9三个月。
雾 南通港年平均雾日最多60天（1951年）最少仅5天（1961年）。4月、5月及12月出现雾的可能性最大。
雾高发时段在半夜到次日上年10时，雾的消散时间一般在上年5时－9时。雾从形成到消散，持续时间在2小时以内的占50%，在3小时内的占66%、在5小时内的达82%。浓雾也可持久不散，其中最长的一次持续了20小时29分（1974年2月17日9时30分开始，18日6时40分结束）。1996年12月27日至31日，南通市连续出现5天的大雾。
助航标志狼山，位于狼山港区，其上建有比高38米的支云塔，明显易识，是识别南通港的重要标志。
龙爪岩，位于狼山西北方，是一条伸入江中的石脊，上设龙爪岩灯塔，装有雷达应答器，信号C，位置孤立易识，是船舶航行的良好导航标志。
南通港沿岸陆上的军山、剑山、黄泥山、马鞍山、任港信号杆以及沿岸高大的烟囱均为良好的导航目标。
长江南通段水域定线制航道两侧设置有完善的灯浮标指示，是船舶在该水域航行的主要依据。但由于长江水域地形复杂，航道、航标变化频繁，来港船舶应参照最新海图，并及时根据《长江下游航道通告》掌握最新情况，以确保航行安全。
洋口港区和吕四港区部分码头的端部设有灯桩，其航道上均设有灯浮指示航道航行障碍物苏通大桥南部以西约1500米有一徐六泾礁群，为一片暗礁，距长江南岸约1500米。
南通港水域通州沙东水道西方的江面，有大片的干出滩和浅滩。
在通州沙的西北侧的青天礁是一礁石滩，其上多暗礁和适淹礁，其西侧边缘有2艘沉船。
天生港水道南方有大面积的沙滩(横埂沙)向东延伸至港口码头对面。
姚港口门附近上下距岸300米内各有适淹礁一块，其东南的集装箱码头外侧有一危险沉船。
长江南通段主航道两侧边缘附近有几处沉船，其中狼山沙以北约2700米的航道灯浮(红22号灯浮与黑22号灯浮)附近有沉船2艘，其中一艘在航道中央，致使该段航道比较狭窄，船舶航行须注意。
自十一圩港向上游至段山港附近沿岸有多处丁坝，伸入江中100米~200米，丁坝在涨潮时淹没，流速大时形成大片浪花。
苏通大桥，位于长江南岸的徐六泾附近至北岸之间，2008年6月30日通车，大桥全长8206米，主塔高300.4米。大桥主跨为主航道通航孔，主通航孔布置深水航道和上、下行推荐航路，主通航孔通航净空宽度为900米，该有效宽度内相应通航净空高度为62米，(设计通航船型为主通航孔5万吨级集装箱船，4.8万吨级船队)。桥南部的常熟港专用航道通航孔布置双向分道通航航道，通航孔通航净空宽度为220米，该有效宽度内相应通航净空高度为39米(设计通航船型为7千吨级散货船)，其他桥孔不通航。大桥设计最高通航水位4.30米，设计最低通航水位-1.46米(黄海高程基准面)。主通航孔桥涵标设在主通航孔桥桁中心线南北各150米迎船面上，专用航道通航孔桥梁迎船面设有桥涵标；主通航孔设桥1至桥6对桥涵标，双向通航/专用水道通航孔设6个浮标。
如皋长江大桥，位于天生港水道上段碾砣港河口上游约500米处，主通航道桥孔为单孔双向通航桥孔，两个主桥墩间净宽为201.5米，主通航孔左右建有副通航孔，两桥墩间净宽均为83米。最高通航水位4.5米(1985国家高程基准)，最低通航水位-1.15米(1985国家高程基准)，通航净空高度10米，可供1000吨级内河货船通过。
华沙大桥，位于长青沙北岸东部至北岸之间，大桥偏北一侧设4个通航孔，其余桥孔为非通航孔，设计最高通航水位6.10米，设计最低通航水位0.76米(吴淞零点为基准)，通航净空高度6米，通航净空宽度25米，未设界限标。
长青沙大桥，位于长青沙北岸东部至北岸之间，大桥在偏长青沙一侧设上、下行通航孔各1个，其余桥孔为非通航孔，设计最高通航水位3.30米，设计最低通航水位-0.43米(1985国家高程基准)，设计通航船型为100吨驳船，通航净空高度4.5米，通航净空宽度25米，已设界限标。
南通华能电厂输煤桥，位于南通天生港水道，起点为华能南通电厂，终点为南方的横港沙外侧的5万吨级华能南通电厂直接输煤码头上游端，大桥全长1417.62米，宽9.8米。大桥桥墩自北向南顺序排列，8号至9号桥墩之间水域为上行通航孔，9号至10号桥墩之间水域为下行通航孔，通航净空高度21米(设计最高通航水位为吴淞高程+6.4米)，通航净空宽度为100米，设计通航船舶为5000吨级顶推船队。通航桥孔迎船面设有桥涵标，方形标牌，红色定光；通航桥孔迎船面两侧桥柱各垂直设置4盏桥柱灯，绿色定光。除上行通航孔和下行通航孔外，其余水上各桥孔均为非通航孔，禁止通航。
洋口港黄海大桥，位于洋口港区，大桥所有桥孔均为非通航孔，严禁船舶通航，并设置了禁航标志。
江苏大唐吕四港发电公司专用煤码头工程引桥，位于吕四港电厂外侧海域，全长3405米，非通航桥梁。
架空电缆，在如皋市南端长青沙北侧长青沙大桥东50米架有如皋市至长青沙有一过江架空电缆，净空高度30米。在长江北支青龙港水道，客运码头下游2.4千米处有崇明至南通220KV过江电缆，设计最高通航高度28米。
水道南通港长江段主航道自浏河口浏黑屋与崇明岛施信杆连线至十一圩河口与小李港河口连线，主航道全长88.8千米，其中浏河口浏黑屋与崇明岛施信杆连线至汇丰码头(长江21号浮)为51.2千米，汇丰码头至十一圩与小李港河口连线37.6千米，主要分为浏河水道、白茆沙水道、通州沙水道等几段。
浏河水道，是长江上海段驶向南通段的第一段长江深水航道，该水道自长江1号灯浮至长江4号灯浮，全长约10千米，水深13米~23米，维护水深为12.5米(理论最低潮面下)。
白茆沙水道，自扬林口上溯至徐六泾，全长33千米，自长江4号灯浮以上分为白茆沙南水道和白茆沙北水道。白茆沙水道是南京以下长江著名的浅险航道，江心散沙和暗礁变化频繁，航槽多变，维护水深为12.5米(理论最低潮面下)。吃水大于4.5米的船舶以及长度在70米以上的海船，限于白茆沙南水道航行。白茆沙北水道为江轮航道，维护水深为4.5米。
通州沙水道，为徐六泾上溯至自龙爪岩之间水域，全长18.5千米，江面甚宽，但江中有通州沙和狼山沙，把航道分为东水道和中水道。通州沙东水道为徐六泾以上陆岸与对面浅滩之间水域，为微呈反“S”型弯曲的沿岸航道，航道维护水深10.5米，为江、海轮共用航道，也是外籍船舶的规定航道。
南通水道，南接通州沙水道，上至横埂沙东端南方的长江33号灯浮附近，全长约15千米，主航道维护水深12.5米。
浏海沙水道，为自西界港(长江33号灯浮附近)至段山港之间水道，全长约19千米，航道微弯，北岸一侧淤浅，大小沙洲错落其中，且向江心伸出。此段江面甚宽，深槽靠南岸，水深15米~50米。
营船港专用航道，自新开沙夹槽出口至营船港，长15.7千米。其中苏通大桥5号左右通航浮至南农闸维护水深10.5米，航宽260米；南农闸至新开闸维护水深为8米，航宽260米；新开闸至靠近华洋码头的Y11号红浮维护水深5.0米，航宽150米(维护水深均为理论最低潮面下起算)。
天生港水道，自通吕河口至如皋北汉口，长27.5千米。其中通吕河口至通沙汽渡维护水深9.0米，航宽150米；通沙汽渡至天生港电厂维护水深5.0米，航宽150米；天生港电厂至小李港维护水深3.2米，航宽150米(维护水深均为理论最低潮面下)。
洋口港区烂沙洋北水道一期航道，为洋口港区的进港航道，全长约18.6千米，宽450米，水深10.6米，航道走向273°35—093°35'，航道两侧设有灯浮。
洋口港区烂沙洋南水道一期航道，位于洋口港区烂沙洋北水道南侧，与之相隔两条沙滩，为洋口港区人工岛南侧码头的进港航道，航道上设有灯浮标，编号S1—S19，S1—S16灯浮间设计水深11.1米，S13—S19灯浮间设计水深9.2米。
吕四港区一期进港航道，位于乌龙沙、横沙沙南则，航道上设有灯浮标，编号吕四1一15，设计水深7.6米，泥沙底。
| 序号 | 泊位名称 | 港区 | 所属单位 | 结构形式 | 长度 | 水深 | 靠泊能力 |
航行于长江水道的船舶，主要依照灯浮标航行，并可参照陆岸显著目标。南通长江通航区域航路航法自2014年4月月1日起均按照《长江江苏段船舶定线制规定（2013）》规定的航路和航法航行，船舶定线制遵循大船小船分流、避免航路交叉、各自靠右航行及过错责任原则。
上行航法 由长江口驶往南通港的船舶，由宝山水道上行，过测河口警戒区后进入长江航道，依照黑浮航行，注意应尽可能与分隔带保持一定横距。若实际吃水大于4．5米以及长度在70米及以上的船舶，驶过长江3号、4号左右通航浮后，把长江5号黑浮置于右舷，进入白茆沙南水道上行；实际吃水在4．5米以下、长度小于70米的船舶，过长江3号浮后适时转向，将长江4号左右通航浮置于左舷、B（1）黑浮置于右舷，驶入白茆沙北水道上行。长江4号左右通航浮附近航路交叉，潮流推压甚剧，应注意船位和会船。船舶与灯浮保持适当横距，沿黑浮上驶，至长江13号、14号左右通航浮之间注意会船，这里是白茆沙南水道与白茆沙北水道上口交会处，也是上行船与下行船的交会处，此段应特别注意落潮流对船位的影响，防止碰压浮标，注意与来船避让的安全。船舶自长江15号黑浮上驶，注意大桥限高与限宽及航行规定，把苏桥1号黑浮置于右舷，进入苏通大桥航段。驶过苏桥4号黑浮后，把苏桥5号左右通航浮、苏桥6号黑浮、长江19号黑浮置于右舷，进入通州沙水道，然后按定线制规定的分道航行沿黑浮上驶。注意长江22号黑浮附近因沉船而使航道变窄，船舶航行须注意。过长江23号黑浮后，可利用狼山塔、龙爪岩灯塔为目标航行。至龙爪岩附近时应保持适当距离，不可接近石咀，与下行船以红灯会让。往狼山港区的船舶，过龙爪岩后可适时转向，驶入港区。上行船舶至30号左右通航浮适时转向，可往天生港区。若继续上行的船舶应以适当横距驶过南通港区，向30号左右通航浮行驶，调整航向，以适当横距驶过31号、32号、33号黑浮，进入测海沙水道。由于32号黑浮附近有一沉船，致使该段航道比较狭窄，航行时注意。
下行航法 由南通港往长江口下行的船舶，采用进港时的逆航路，按定线制规定的分道航行沿红浮下驶，注意长江22号红浮附近因沉船而使航道变窄，船舶航行须注意。船舶于长江20号红浮至19号红浮之间适时调整航向，于苏桥6号左右通航浮前做好通过苏通大桥的准备，逐渐由通州沙水道转苏桥4号、5号左右通航浮之间都有进出常熟电厂的船舶，注意会船，并注意苏桥5号左右通航浮南侧800米的徐六泾礁群。船舶航行应注意涨落潮流流压的影响，防止碰压浮标。过苏桥1号红浮后，进入白茆沙水道。实际吃水大于4．5米、长度在70米以上的船舶，适时调整航向，将15号红浮、14号红浮置于右舷，继续沿白茆沙南水道下驶转入测河水道。其他船舶，过15号红浮后，将14号左右通航浮置于右舷，转入白茆沙北水道下驶，至4号左右通航浮附近再转入浏河水道。船舶在15号红浮至14号左右通航浮至之间注意会船，这里是白茆沙南水道与白茆沙北水道交会处，此段应特别注意潮流对船位的影响，防止碰压浮标。船舶沿浏河水道下行，过1号红浮后，进入长江上海港段水域，应注意内河港与上海港规定的区别，遵守上海海事局的规定，如航行灯、声号和航路的规定
注意事项：
凡进长江江苏段长江1号浮水域的客轮、装载危险货物船舶、1000总吨及以上的船舶（队）应用甚高频10频道（VHF10）或电话向南通交管中心报告。报告内容：船名（呼号）、国籍、船籍港、总长、总吨、吃水、货物种类、始发港或上一港、目的港及海事主管机关需要了解的其他信息。此外，上行船在长江15号浮报告船位；下行船在长江36号浮和20号浮报告船位。
来往南通港的船舶，要坚持正常守听，收听有关安全信息，发现来船应及时呼叫沟通，协调避让行动。
若遇个别浮标漂失、移位，在平坦顺直的水道上，可用雷达助航，但航路交叉、转弯等处切忌采用，一定要准确辦别浮标的具体位置。
白茆沙水道的维护水深，根据航道自然水深情况而变动，来港船舶应注意当月航道公报，以策安全。
白茆沙水道上、下口交会处，航标设置较密，应掌握其位置、灯质和灯色，以防识别错误。
苏通大桥桥区水域流压较大，背景灯光复杂，船舶航经此水域应摆正船位，注意流压，正确识别航道标志，切勿误航导致触碰桥墩事故。
浏河口附近、长江1号浮外侧常有海轮锚泊，夜间灯光耀眼，过往船舶应謹慎驾驶。
南通港长江段水域主航道和长江北支水域共有皋张、通沙、通常、海太4条汽渡线，汽渡船频繁横越主航道，且汽渡线均临近专用航道或北支水道，船舶流量较大，通航环境复杂，船舶航经上述水域须注意。
长江30号～33号浮水域，通沙汽渡以及进出水上服务区、天生港水道、通昌河口、九圩港河口的船舶频繁横越航道，与顺航道船舶形成紧迫局面的事几率增大，极易发生碰撞事故险情，船舶经过该水域时，应加强暸望、减速慢行、谨慎驾驶，确保安全
武港码头（对应长江9号浮）有超大型海轮（15万吨～20万吨级）靠离泊作业，尤其在海伦离泊掉头期间，将在一定时段占用下行船船推存航路，同时也对下行通航分道内大型船舶的航行构成一定的影响，过往船舶航经该码头前沿水域时，要加强暸望，服从海事管理机构的统一指挥，谨慎会让。
太仓港国际集装箱码头上下游水域，船舶靠离泊作业、进出锚地频繁，各过往船舶经过该水域时，应加强暸望、谨慎驾驶。
长江14号左右通航浮水域，在涨潮流时间段仍有少部分小型船舶违反定线制规定，时常占据深水航道航行。在涨潮时段，长江14号～15号浮南侧
水域有部分下行黄砂船在航路附近锚泊候潮，时常出现占据推荐航路现象，船舶航经上述水域须注意。
通海港区的海螺码头附近水流复杂，受涨潮流影响大，如船舶在海螺码头附近锚泊极易发生走锚、碰撞码头引桥等事故或险情。
苏通大桥上端北岸一侧及通常汽渡以上南岸一侧区域内船舶密度较大，船舶横越航道现象多，船舶航经该水域要加强暸望，注意避让，减速通过。
常熟港专用航道上下口、永钢、营船港水道下口进出船舶较多，航路较为复杂，对航行船舶影响较大，请过往船舶加强瞭望，谨慎驾驶。
在苏桥2号～5号浮间，时常有小型船舶违章横越，桥梁下游有渔船占用航道捕鱼，航道边缘时常有吸铁船进行废铁打捞，过往船舶应加强暸望，注意避让，谨慎通过。
长江19号黑浮北侧水域为新开沙尾部，部分进江小海轮、小型船舶及进出营船港水道的船舶不熟悉航路、贪走捷径、缓流，偏离规定航路，极易发生搁浅事故。船舶经过该水域时，应严格按照定线制规定沿上行分道航路航行，进出营船港水道应从桥5号左右通航浮进出。
营船港专用航道下口因水深条件变化频繁，船舶航行至Y2号浮附近水域时稍有不慎易造成搁浅事故或险情，船舶应按定线制规定进出营船港专用航道并谨慎驾驶。
营船港专用水道内各码头以及新大港储、华盛、通吕、越江、华能江心码头等码头大潮汛期间容易发生船舶走锚卡压码头的事故，来港船舶应在海事管理机构公布的错地、停泊区内停泊，严禁在上述码头上下游附近水域锚泊，防止发生走错卡压码头的事故。
南通港区航道紧贴北岸码头，船舶靠离码头和横越频繁，通航环境较复杂，船舶经过该水域时，应加强瞭望、谨慎驾驶。长江22号浮、33号浮水域航道处于拐点位置，船舶追越时由于间距保持不足或操作不当等极易发生船吸现象，导致船舶碰撞事故的发生，船舶航经上述水域时尽量避免追越行为。
天生港水道上段、长江36号黑浮至长青沙闸航段、长江北支航段沿岸船厂较多，新造船舶下船台、出坞作业频繁，船舶经过上述水域时，应加强与附近水域海巡艇或警戒船舶的联系，加强暸望、谨慎驾驶，防止与新造船舶发生碰撞事故，或受下船台船舶造成的涌浪影响发生浪损事故
20号灯浮至龙爪岩一带，鱼汛期渔船甚多，浒浦附近有许多机动渔船出海，并常有误开号灯情情况，船舶航经该水域时应认真暸望和辨别。
南通港各港区码头夜间照明灯光耀眼，灯浮标难以辨认，夜航船舶须仔细判别。
交通部长江引航中心在该港设有南通引航站，负责宝山引航交接地至南通港及由南通港始发的中外籍船舶的引航服务。南通港对外籍船舶实行强制引航，对国内远洋船舶或其他进港海轮提供引航技术服务。
船舶、船东或代理申请引航时应按要求填写《长江引航、移泊申请单》，并注明中英文船名、船长、吃水、高度、总吨、净吨、装载情况、起讫地点及预计抵、离港时间等。进江船舶的引航申请单应在船舶到达起引航点48小时前递交或传真至引航站，并在船舶抵达起引航点24小时前向引航站确报；出港或移泊船舶的引航申请应提前24小时递交或传真至引航站。无代理的船舶可以来人或通过电话申请。进江船舶的起引时间如有变化，应及时通知引航站；出港或移泊船舶的起引时间如有变化，应提前4小时通知引航站。特种船舶申请引航时，应提前48小时向引航站递交《特种船舶申请表》。
需要引航的船舶，由宝山引航交接地用甚高频72频道（VHF72）或甚高频09频道（VHFO9）与南通港引航站联系，由引航站派遣引航员在宝山引航交接点登船。
位于浏河水道长江1号黑浮至长江2黑号浮连线北侧，在下列4点连线水域范围内，长1600米，宽800米，水深13米～20米，泥沙底，供危险品船锚泊。
| 经度 | 纬度 |
| 121°19′57″E | 31°33′24″N |
| 121°20′22″E | 31°33′40″N |
| 121°19′44″E | 31°34′21″N |
| 121°19′20″E | 31°34′04″N |
位于浏河水道长江6号黑浮至长江7号黑浮连线北侧，在下列4点连线水域范围内，长3000米，宽800米，水深12米～15米，泥沙底，供海轮锚泊。
| 经度 | 纬度 |
| 121°15′00″E | 31°38′21″N |
| 121°15′24″E | 31°38′39″N |
| 121°14′02″E | 31°39′48″N |
| 121°13′42″E | 31°39′30″N |
位于白茆沙西南侧，在下列6点连线水域范围内，水深8米～15米，泥沙底。
| 经度 | 纬度 |
| 121°09′54″E | 31°41′50″N |
| 121°10′21″E | 31°42′04″N |
| 121°09′24″E | 31°43′12″N |
| 121°08′30″E | 31°44′22″N |
| 121°07′42″E | 31°44′00″N |
| 121°08′34″E | 31°42′54″N |
位于白茆沙西北侧，在下列4点连线水域范围内，水深4米～7米，泥沙底。
| 经度 | 纬度 |
| 121°10′04″E | 31°45′34″N |
| 121°10′14″E | 31°46′04″N |
| 121°08′21″E | 31°46′27″N |
| 121°08′14″E | 31°45′57″N |
位于苏通大桥东侧，在下列4点连线水域范围内，水深12米～16米，泥沙底。
| 经度 | 纬度 |
| 121°04′24″E | 31°46′34″N |
| 121°04′28″E | 31°46′52″N |
| 121°01′26″E | 31°47′14″N |
| 121°01′24″E | 31°46′54″N |
位于苏通大桥西方的狼山沙南侧，在下列6点连线水域范围内，长4000米，宽700米，水深7米～21米，泥沙底，供待泊及过驳使用。
| 经度 | 纬度 |
| 120°55′38″E | 31°46′16″N |
| 120°55′56″E | 31°46′45″N |
| 120°54′52″E | 31°46′58″N |
| 120°53′20″E | 31°47′20″N |
| 120°53′14″E | 31°47′02″N |
| 120°54′42″E | 31°46′32″N |
位于长江23号黑浮至长江24号黑浮连线北侧，在下列4点连线水域范围内，长2492米，宽872米，水深4米～14米，泥沙底，供危险品船锚泊。
| 经度 | 纬度 |
| 120°53′52″E | 31°52′19″N |
| 120°54′24″E | 31°52′25″N |
| 120°53′31″E | 31°53′38″N |
| 120°54′04″E | 31°53′44″N |
位于狼山塔南侧1．3链处，在下列4点连线水域范围内，长2500米，宽500米，面积约1．5平方千米，水深为12米～30米，泥沙底，可供船舶检疫。
| 经度 | 纬度 |
| 120°53′09″E | 31°55′09″N |
| 120°53′24″E | 31°55′17″N |
| 120°52′48″E | 31°56′27″N |
| 120°52′24″E | 31°56′27″N |
位于通州沙北侧1．2链处，在下列5点连线水域范围内，长2500米，宽1000米，水深5米～14米，泥沙底，可供长江内驳船停泊。
| 经度 | 纬度 |
| 120°49′23″E | 31°58′22″N |
| 120°49′38″E | 31°58′51″N |
| 120°48′56″E | 31°59′25″N |
| 120°47′14″E | 32°00′04″N |
| 120°46′51″E | 31°59′22″N |
位于南通港二号甲锚地西侧，在下列4点连线水域范围内，水深11米～27米，泥沙底。
| 经度 | 纬度 |
| 120°45′18″E | 31°59′51″N |
| 120°45′54″E | 32°00′32″N |
| 120°43′54″E | 32°00′18″N |
| 120°43′54″E | 31°59′45″N |
位于LNG码头东侧约400米处，在以32°32′59″N、121°27′17″E为中心1180米为直径的圆形水域范围内，水深14．4米。
| 半径 | 经度 | 纬度 |
| 0.64 | 121°27′17″E | 32°32′59″N |
位于吕四港1号灯浮的南方约1海里处，在以31°45′00″N、122°16′00″E为中心、2500米为半径的圆形水域范围内，水深15米，泥沙底。由于该错地距离亚太光缆过近，锚泊时请注意。
| 半径 | 经度 | 纬度 |
| 1.35 | 122°16′00″E | 31°45′00″N |
位于洋品港区外的洋口YK号灯浮标东偏南方约2．3海里处，在下列4点连线水域范围内，水深22米，泥沙底。
| 经度 | 纬度 |
| 122°00′00″E | 32°30′00″N |
| 122°01′28″E | 32°30′00″N |
| 122°01′28″E | 32°28′34″N |
| 122°00′00″E | 32°28′34″N |
位于洋口港区人工岛南侧、黄海大桥东侧1000米处，水深6米，泥沙底。洋口港重件运输船和散货船锚地位于洋口港18号灯浮南侧，在下列4点连线水域范围内，水深10．6米，泥沙底。
| 经度 | 纬度 |
| 121°27′35″E | 32°30′08″N |
| 121°28′31″E | 32°29′59″N |
| 121°28′28″E | 32°29′43″N |
| 121°27′31″E | 32°29′52″N |
位于吕四港2号灯浮的南侧，在以31°51′00″N、122°12′30″E为圆心、2000米为半径的圆形水域范围内，水深17米，泥沙底。
| 半径 | 经度 | 纬度 |
| 1.08 | 122°12′30″E | 31°51′00″N |
位于吕四港4号灯浮的南侧，在以31°53′39″N、122°07′05″E为圆心、0．5海里为半径的圆形水域范围内，水深15．3米，泥沙底。
| 半径 | 经度 | 纬度 |
| 0.5 | 122°07′05″E | 31°53′39″N |
位于吕四港15号灯浮东方的一条深水槽内，在下列4点连线水域范围内，水深11．4米，泥沙底。
| 经度 | 纬度 |
| 121°43′30″E | 32°06′34″N |
| 121°43′16″E | 32°06′17″N |
| 121°44′18″E | 32°05′40″N |
| 121°44′32″E | 32°05′57″N |
南通港长江段水域有3条水底电缆缆线保护水域范围内禁止船舶抛锚。具体情况详见水下电缆表。
位于洋口港区外的洋口YK号灯浮标西方约1海里处，在下列4点连线水域范围内，呈正方形，边长1180米，水深16米～22米，泥沙底，供LNG船舶使用。
| 经度 | 纬度 |
| 121°51′48″E | 32°31′21．42″N |
| 121°52′33″E | 32°31′18．82″N |
| 121°52′30″E | 32°30′40．60″N |
| 121°51′45″E | 32°30′43．20″N |
码头 南通港现拥有生产用码头泊位109个，码头岸线总长17540米，其中万吨级以上码头泊位54个。南通港口集团有限公司有如皋、天生、通沙、姚港、狼山、集装箱、江海等港务公司，码头具体情况详见南通港口集团有限公司主要码头泊位表。
此外，南通港还拥有众多的企业生产性码头泊位，具体情况详见南通港主要企业码头泊位表。
系船浮筒 南通港二号甲错地系船浮筒，设置在长江28－1号灯浮～29号灯浮南侧，由4具系船浮简组成，编号为21号～94号，其中21号～22号间距为90米，22号～23号间距为380米，23号～24号间距为1000米，系泊能力为2．5万吨级，由南通港口集团有限公司设置。
天生港水道系船浮筒，位于天生港水道天（2）红浮与天（3）红浮南侧，现有5具系船浮筒，编号T12至T16，其中T12、T13两两浮筒系泊能力为7000吨级；T14～T16系船浮筒系泊能力为500吨级，T12～T13间距为220米，T13～T14、T14～T15间距为170米、T15～T16间距为180米，由南通港口集团有限公司设置。
装卸设备 该港现有各类生产用装卸机械1061台，其中起重机械331台，包括固定式起重机88台，汽车起重机4台，轮胎起重机43台，门式起重机62台，浮式起重机26台，桥式起重机23台，门式起重机8台。输送机械263台；装卸搬运机械348台，其中叉式装卸车128台，单斗车107台，集装箱牵引车33台，载重汽车34台；专用机械109台；其中装船机6台，卸船机16台，推粑机38台，装车机6台，堆料机3台，斗轮堆取料机8台，推土机7台，集装箱起重机11台，装油臂19台。
仓库堆场 港务局生产用库场总面积为147．6万平方米，容量992．5万吨。其中港口有仓库面积21．2万平方米，容量6．6万吨。包括危险品仓库面积1175平方米，容量316吨；圆筒仓容积17．4万立方米，容量14万吨；油库容积178．1万立方米，容量143万吨，含成品油油库容积66．9万立方米，容量52．9万吨；液体化工储罐容积51．5万立方米，容量114．3万吨。
港口有生产用堆场126．4万平方米，容量654．5万吨，内煤场总面积28．7万平方米，容量124．3万吨；集装箱堆场总面积14．6万平方米，堆存能力14900标准箱；输油管线总长110205米。
修造设备 南通港修造船实力雄厚，拥有大型的修船基地和造船企业。南通中远船务工程有限公司，拥有1120米的天然深水岸线，占地面积21万平方米，现有15万吨级“南通”号和8万吨级“远通”号浮船坞两座，可承接各类船舶的修理业务，年修理能力150余艘远洋船舶。
南通中远川崎船舶工程有限公司是中国远洋运输（集团）总公司与川崎重工业株式会社合资兴建的大型造船企业，占地面积56万平方米，船坞长350米、宽68米、深12.8米，码头长度540米，拥有两座300吨起重能力的门式起重机及150吨起重能力的摇臂式起重机，最大可建造30万载重吨船舶。
港务船舶 工作船共有20艘，总吨位5334吨，总功率21025千瓦。其中拖轮12艘，总功率19355千瓦，其中全回转拖轮4艘，最大功率4000千瓦；供应船1艘，总吨位316吨；交通船5艘，载客量480座；垃圾船1艘，总吨位101吨。
供给 南通港现有专用供水船、油船。港口背依市区，共有十多家港口供应公司可为船舶提供丰富的生活物资。南通对外供应公司可供给食品及船用物资，南通燃料供应公司可供燃料油及各种机油，南通外轮服务公司可为船舶提供淡水和劳务服务。
国内外船舶可通过甚高频无线电话、单边带无线电话等联络方法直接与南通岸台联系。南通话台工作频道为VHF27频道，南通海事局为VHF10频道，南通外轮代理公司为VHF11频频道，南通外运代理公司为VHFO7频道。
船舶交通管理系统（VTS）南通VTS系统建有“五站一中心”，分别为南通VTS中心、浏家港雷达站、海门雷达站、白茆雷达站、黄泥山雷达站和开沙雷达站，另在海门雷达站设置甚高频（VTHF）基站座、黄泥山站设置甚高頻（VHF）基站一座和船舶自动识别系统（AIS）基站一座，主要监控水域为长江1号～长江36号浮间水域船舶的航行、停泊和作业情况。
南通市沿海共建设三个甚高频（VHF）基站，包括洋口港基站、东灶港基站和圆陀角基站，属于江苏省海事局沿海甚高频（VHF）安全通信系统的重要组成部分。其中洋口港基站（32°25′46″N、121°19′03″E）使用VHF10频频道、16频道、70频道，东灶港基站（32°06′39″N、121°27′03″E）使用VHFO4频道、16频道，圆陀角基站（31°41′48″N、121°53′33″E）使用VHF16频道、27频道、70频道，覆盖了南通市210千米的沿海水域。
长江江苏段VHFO6频道为船舶航行通话频道，VHF69频道为公共信息和船舶值守频道；长江1号～长江32号浮间船舶报告使用频道为VHF11频道（苏通大桥以上水域）和和VHF10频道（苏通大桥以下水域）。
南通船舶交通管理系统（VTS）中心
地址：南通市山水路90号
联系由话：0513－81150062，81150063
传真：0513-81150061
邮政编码：226004
打捞救助 南通市水上搜救中心设在南通市海事局。南通港区域内的南通航道处、盐城稳强疏浚打捞工程有限公司、江苏蛟龙打捞航务工程有限公司南通分公司等打捞公司共有打捞工程船14艘，最大吨位为542吨，最大抗风能力为10级，最大起重能力为150吨。
南通市港口管理局
地址：南通市青年西路38号
电话：0513－83559358
传真：0513－83559359
邮编：226006
中华人民共和国南通海事局
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南通港口集团有限公司
地址：南通市青年西路12号
电话：0513－85167716
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邮编：226006
长江引航中心南通引航站
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南通市沿海港区引航站
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电话：0513－83559375
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邮编：226006
中华人民共和国南通海关
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中华人民共和国南通出入境检验检疫局
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中华人民共和国南通边防检查站
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中国外轮代理公司南通分公司
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